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    数据挖掘在生物医学数据分析中的应用
    龚著琳, 陈 瑛, 苏 懿, 等
       2010, 30 (11): 1420-.   DOI: 10.3969/j.issn.1674-8115.2010.11.025
    摘要1805)      PDF (3895KB)(2097)   

    随着信息技术的发展,采集、存储和管理数据的手段日益完善,数据挖掘学科应运而生。文章阐述数据挖掘的概念;通过给出各种数据挖掘方法在生物医学研究领域中的应用实例,分析数据挖掘与生物医学领域中统计学的关系,并就国内生物医学数据挖掘的应用现状、需要解决的问题以及今后研究的发展方向等进行综述。

    相关文章 | 多维度评价
    突触结合蛋白2基因多态性与中国汉族精神分裂症的关联研究
    阳红, 黄欣欣, 刘超, 梁青松, 杨华, 张建标, 徐健, 王颖怡, 吴海苏, 吕钦谕, 易正辉
    上海交通大学学报(医学版)    2021, 41 (1): 16-22.   DOI: 10.3969/j.issn.1674-8115.2021.01.003
    摘要94)   HTML1)    PDF (1352KB)(304)   

    目的·探讨突触结合蛋白2(synaptotagmin 2,SYT2)基因与中国汉族人群精神分裂症(schizophrenia,SZ)的关联性。方法·采用TaqMan探针基因分型技术对478例SZ患者(SZ组)和474名健康对照者(HC组)的SYT2基因的5个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点(rs6427957、rs907697、rs12564274、rs10800856、rs61820945)进行检测分型,应用HaploView软件、SHEsis及SNPstats在线软件比较SZ组与HC组的等位基因、基因型、不同遗传模式下基因型以及单倍型频率分布有无差异。结果·rs10800856位点等位基因及基因型频率分布在SZ组与HC组之间差异有统计学意义(P=0.003,P=0.012);经Bonferroni 校正后,rs10800856位点等位基因频率差异仍有统计学意义(P=0.015),基因型频率差异无统计学意义。rs10800856位点在显性及加性遗传模式下,基因型频率分布在SZ组与HC组之间比较差异有统计学意义(P=0.004,P=0.005),校正后差异仍有统计学意义(P=0.020,P=0.025)。由rs12564274-rs10800856-rs61820945组成的单倍型C-T-C频率分布在SZ组与HC组间差异有统计学意义(P=0.009);经Bonferroni校正后,差异仍具有统计学意义(P=0.036)。结论·在中国汉族人群中,SYT2基因可能是SZ的易感基因,rs10800856位点可能与精神分裂症发病风险有关联。

    图表 | 参考文献 | 相关文章 | 多维度评价
    蛋白质精氨酸甲基转移酶在肿瘤中的作用及机制研究进展
    文君,闵雪洁,赵丽,赵小平
    上海交通大学学报(医学版)    2017, 37 (6): 842-.   DOI: 10.3969/j.issn.1674-8115.2017.06.022
    摘要977)      PDF (7473KB)(1146)   

    蛋白质精氨酸甲基转移酶(PRMT) 能甲基化多种蛋白,包括组蛋白和非组蛋白,影响多种细胞过程,如转录、RNA 剪接、 DNA 修复、细胞周期的控制等。PRMT 的活性受多种调节机制影响,它的异常表达在疾病的发生发展中起重要作用,尤其是肿瘤, 如乳腺癌、白血病等。PRMT 在肿瘤诊断或治疗中有着独特的价值。随着 PRMT 甲基化机制的深入探索,目前 PRMT 选择性抑制剂 的研究已取得一定进展,PRMT 特异性抑制剂有望成为治疗肿瘤的精准靶向药物。

    相关文章 | 多维度评价
    外胚层发育不良分子机制及子代出生缺陷的研究进展
    顾本宏,田汝辉,李铮
    DOI: 10.3969/j.issn.1674-8115.2017.02.022
    纳米金抗菌机制及应用研究进展
    褚光宇,陈云丰
    上海交通大学学报(医学版)    2018, 38 (11): 1386-.   DOI: 10.3969/j.issn.1674-8115.2018.11.021
    摘要581)      PDF (8588KB)(553)   
    细菌多重耐药是当今临床面临的一大挑战。纳米金( gold nanoparticles,AuNPs)因其独特的理化性质,无论是用作抗菌药物载体还是自身修饰后用作治疗剂,均在体内、体外展现出良好的抗菌效果。 AuNPs的抗菌谱广,抗菌机制多样,且生物相容性好,具有良好的临床应用前景。但是对于其在体内环境下的结构稳定性、抗菌机制、长期安全性、表面修饰物的细胞毒性等的认知仍有待于通过后续研究深入探讨和完善。
    相关文章 | 多维度评价
    《上海交通大学学报(医学版)》简介
    上海交通大学学报(医学版)    2019, 39 (12): 2-.  
    摘要99)      PDF (947KB)(481)   
    相关文章 | 多维度评价
    上海交通大学医学院病原生物学教研室简介
       2012, 32 (11): 1400-.  
    摘要835)      PDF (1444KB)(1221)   
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    阑尾原发性滤泡性淋巴瘤一例报道及文献复习
    谢 蕴, 潘玉林, 金晓龙, 等
       2009, 29 (7): 889-.  
    摘要1158)      PDF (5177KB)(1496)   

    目的 报道国内首例阑尾原发性滤泡性淋巴瘤(FL),结合文献复习探讨其病理学特征和鉴别诊断。方法 1例临床诊断为急性阑尾炎的患者,入院后即行阑尾切除手术。阑尾切除标本经HE染色后进行组织病理学检查;免疫组织化学染色检测细胞表面标志物表达。结果 病理学检查发现,阑尾管壁局部增厚达0.8 cm,镜下肠壁内大量淋巴滤泡样结节浸润。免疫组织化学染色显示,生发中心B细胞表达bcl-2、CD20、CD79a、CD10和bcl-6。病理学诊断:“阑尾原发性FL 1级,滤泡占85%;急性化脓性阑尾炎”。术后B超、PET/CT检查和骨髓活检均未见异常。随访18个月肿瘤无复发。结论 阑尾原发性FL非常罕见。肿瘤性滤泡无套区和边缘区结构;肿瘤细胞特征性地表达bcl-2。

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    UUO模型大鼠肾间质纤维化动态进展及α-SMA、TGF-β1和VDR表达变化
    谢盛彬, 王伟铭, 陈 楠
       2010, 30 (7): 752-.  
    摘要2955)      PDF (12513KB)(1515)   

    目的 观察单侧输尿管梗阻(UUO)模型大鼠肾小管间质纤维化动态进展,研究该病理过程中肾脏纤维化相关蛋白表达的变化。方法 32只清洁级SD大鼠随机分为假手术组(n=16)和UUO模型组(模型组,n=16)。两组大鼠分别于术后(模型组建模后)第2、5、9、14天分批(n=4)处死,留取手术侧(模型组梗阻侧)肾脏组织。分别采用HE和Masson染色、免疫组织化学染色及Western blotting等方法,评价肾小管间质纤维化损伤程度并检测肾脏组织α平滑肌肌动蛋白(α-SMA)、纤维连接蛋白(FN)、维生素D受体(VDR)及转化生长因子β1(TGF-β1)等相关蛋白的表达。结果 肾脏组织形态学观察显示,随着输尿管梗阻时间的延长,肾小管间质纤维化程度逐步加重。免疫组织化学染色显示,模型组大鼠建模后各时间点肾间质α-SMA和FN阳性面积百分比均显著高于假手术组(P<0.05),且随着梗阻时间的延长逐渐升高,至建模后第14天时达到高峰。Western blotting分析表明,模型组大鼠建模后各时间点α-SMA和TGF-β1相对表达量均显著高于假手术组(P<0.05),而VDR相对表达量显著低于假手术组(P<0.05);建模后第2天,模型组大鼠肾脏组织α-SMA相对表达量已显著增加;建模后第14天,模型组α-SMA和TGF-β1相对表达量分别增高至假手术组的12.7倍和8.8倍,而VDR相对表达量下降至假手术组的3%。结论 UUO模型大鼠建模后第14天可出现显著的肾间质纤维化;建模早期肾间质中α-SMA表达增加提示肾间质成纤维细胞的活化;VDR表达的进行性减少提示其与肾间质纤维化有关。

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    钾氯共转运体-2调节机制的研究进展
    赵华平, 薛庆生, 于布为, 等
       2011, 31 (5): 659-.   DOI: 10.3969/j.issn.1674-8115.2011.05.028
    摘要1436)      PDF (4229KB)(1560)   

    钾氯共转运体-2(KCC2)是阳离子和氯离子共转运体家族中的一员,广泛分布于中枢神经系统(CNS),主要负责把细胞内的氯离子泵出细胞外,维持抑制性神经元的抑制功能所必需的低氯环境。KCC2的下调参与一些神经系统疾病和疼痛的发生和发展,而KCC2本身亦受多种因素的调节。该文就KCC2的调节机制作一综述。

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    国内外大学生心理健康研究现状的对比及启示
    鲁 威, 赵 敏
       2012, 32 (10): 1382-.   DOI: 10.3969/j.issn.1674-8115.2012.10.023
    摘要2252)      PDF (404KB)(1582)   

    近年来我国大学生心理健康研究发展较快,但与发达国家相比还存在一定的差距。该文通过对近年国内外相关文献的分析,对我国大学生心理健康状况和研究方法等方面进行总结,并与国外相关研究进行比较。建议今后在研究队伍、研究理念、研究视野和内容等方面加强对我国大学生心理健康的研究。

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    2018 年度华夏医学科技奖上海交通大学医学院系统获奖名单
    上海交通大学学报(医学版)    2018, 38 (11): 2-.  
    摘要197)      PDF (423KB)(777)   
    相关文章 | 多维度评价
    上海交通大学医学院附属仁济医院生殖医学科简介
       2012, 32 (8): 963-.  
    摘要976)      PDF (719KB)(1639)   
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    129例永存原始玻璃体增生症的临床特征和术后疗效分析
    朱瑜洁, 赵培泉, 张 琦
    上海交通大学学报(医学版)    2013, 33 (6): 846-.   DOI: 10.3969/j.issn.1674-8115.2013.06.030
    摘要986)      PDF (367KB)(1299)   

    目的 分析永存原始玻璃体增生症(PHPV)的临床特征及术后疗效。方法 回顾性分析了129例PHPV患儿的相关临床资料,包括术前视力、眼压、眼轴长度以及PHPV分型,以单眼患儿的对侧眼作为正常对照组。并对适应证患儿进行手术治疗,手术方法以晶状体切除和玻璃体切除为主;随访时间1~40个月。结果129例PHPV病例(138眼)中,男性82例(63.6%),女性47例(36.4%);初诊年龄6 d~13岁,平均(2.8±3.1)岁。PHPV分型:前部型占5.1%(7/138),后部型占15.2%(21/138),混合型占79.7%(110/138)。术前检查显示:33.3%(11/33)的患眼视力≥0.1,27.3%(9/33)的患眼视力低于手指数(包括无光感及光感和手动),28只正常对照眼视力均≥0.1;77.1%(37/48)的患眼眼压正常,95.2%(40/42)的正常对照眼眼压正常;术前不同年龄段儿童患眼(共45眼)的平均眼轴长度均小于正常对照眼(共36眼)。47例患儿(49眼)获得随访,其中手术治疗34例,术后患眼并发症基本得以解除,共有10只患眼测得视力,30%(3/10)的患眼视力≥0.1,10%(1/10)的患眼视力低于手指数。结论 该组PHPV患儿群体平均就诊年龄偏大、年龄跨度大,以混合型及后部型病例为主。手术病例视力改善有限,但对有用视力保存、并发症防治有较好的效果。

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    不同培养基对血液透析用水细菌菌落检测比较
    蔡 宏,张伟明,杨海慧,等
    DOI: 10.3969/j.issn.1674-8115.2014.01.012
    2018 年度国家科学技术奖上海交通大学医学院系统获奖名单
    上海交通大学学报(医学版)    2019, 39 (1): 0-.  
    摘要197)      PDF (378KB)(409)   
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    上海交通大学医学院- 国家热带病研究中心全球健康学院成立
    上海交通大学学报(医学版)    2019, 39 (7): 3-.  
    摘要211)      PDF (1818KB)(366)   
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