%A 曹颖颖,朱小强,陈豪燕 %T 基于非负矩阵分解模型构建胃癌分子分型及预后评估的案例分析 %0 Journal Article %D 2017 %J 上海交通大学学报(医学版) %R 10.3969/j.issn.1674-8115.2017.09.001 %P 1188- %V 37 %N 9 %U {https://xuebao.shsmu.edu.cn/CN/abstract/article_11660.shtml} %8 2017-09-28 %X 目的 · 探究基于非负矩阵分解(NMF)模型构建胃癌分子分型对预后评估的作用。方法 · 从 GEO 下载胃癌样本转录组芯片数 据集分别作为探索集和验证集,挖掘lncRNA 数据集,利用 Consensus Cluster Plus 软件包构建 NMF 分子分型模型。评估各亚组与患 者预后及各项临床指标的相关性。结果 · 基于 NMF 模型将所有样本分为高危、中危和低危 3 个亚组。结合临床病理信息,发现复发 时间、淋巴结转移阳性率、Lauren 分型、TNM 分期、发病年龄在 3 个亚组间的分布差异具有统计学意义。在 GSE62254 和 GSE15459 中生存分析提示高危组复发时间更短,多因素 Cox 风险比例回归分析提示基于 NMF 模型的分子分型是胃癌预后的独立预测因子。基 因集差异分析(GSVA)和基因集富集分析(GSEA)发现高危组富集多个与肿瘤发生相关的通路。结论 · 基于 NMF 模型构建的胃癌 分子分型对胃癌患者预后评估具有一定的指导意义。