%A 张宁1, 2,韩阳1, 2,骆菲3,朱丽红4,秦金红2,江滟1 %T 运用实时定量PCR 和16S rDNA 测序法分析女性阴道菌群的结果比较 %0 Journal Article %D 2018 %J 上海交通大学学报(医学版) %R 10.3969/j.issn.1674-8115.2018.01.013 %P 71- %V 38 %N 1 %U {https://xuebao.shsmu.edu.cn/CN/abstract/article_11787.shtml} %8 2018-01-28 %X 目的· 比较实时定量PCR(qPCR)法与16S rDNA 测序法分析女性阴道菌群类型的结果。方法· 选取45 岁以下育龄期健康
女性49 名,采集阴道上1/3 处分泌物,经提取阴道标本全基因组DNA 后,分别运用16S rDNA V1V2 域测序和基于22 种常见阴道
细菌设计的引物进行qPCR 分析各样本菌群类型,比较2 种检测结果的异同。结果· 参考依据优势菌类型的阴道菌群分类标准,基于
qPCR 方法分析结果为Ⅰ型(卷曲乳杆菌为优势菌)9 例,Ⅲ型(惰性乳杆菌为优势菌)24 例,Ⅳ型(无乳杆菌为优势菌)12 例,Ⅴ
型(詹氏乳杆菌为优势菌)为2 例。基于16S rDNA V1V2 域进行测序分析的结果为Ⅰ型13 例,Ⅱ型(格氏乳杆菌为优势菌)1 例,
Ⅲ型23 例,Ⅳ型8 例,Ⅴ型2 例。2 种方法对阴道菌群分型一致的为38 例,一致率为77.6%。结论· 2 种方法分析得到的阴道菌群分
类结果有差异;若采用qPCR 对阴道菌群进行分类,还需考虑相关的技术因素对结果的影响。