%A 张鹏 1,常争艳 2,杨磊 1,薛松 1,连锋 1 %T 缺血性心肌病差异表达基因的生物信息学分析 %0 Journal Article %D 2019 %J 上海交通大学学报(医学版) %R 10.3969/j.issn.1674-8115.2019.07.003 %P 698- %V 39 %N 7 %U {https://xuebao.shsmu.edu.cn/CN/abstract/article_12275.shtml} %8 2019-07-28 %X 目的 ·应用生物信息学方法探讨缺血性心肌病( ischemic cardiomyopathy,ICM)中差异表达的相关基因,构建竞争性内源 RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)调控网络。方法 ·从基因表达数据库中下载数据集,筛选出 ICM样本与正常样本差异表达的 mRNA和长链非编码 RNA(lncRNA),并进行 GO(Gene Ontology)功能分析和 KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)通路分析。分析差异表达的 mRNA和 lncRNA,运用生物信息学方法进行 miRNA预测分析,构建 ceRNA调控网络。结果 · GO功能分析和 KEGG通路分析结果表明,差异表达基因在代谢途径、氧化磷酸化、细胞外基质受体相互作用等通路显著富集,并与内质网应激、纤维化、胶原的分解代谢过程、炎症反应功能密切相关。构建了 ICM lncRNA相关的 ceRNA调控网络,包含 26个 mRNA、2个 lncRNA和 15个 miRNA。结论 ·采用生物信息学方法能够有效分析 ICM差异表达的基因,并成功构建了缺血性心肌病 ceRNA调控网络。