上海交通大学学报(医学版), 2023, 43(10): 1255-1261 doi: 10.3969/j.issn.1674-8115.2023.10.005

论著 · 临床研究

青少年的成人起病型糖尿病家系NEUROD1基因突变的筛查与功能解析

张娟,1, 葛晓旭2,3, 张荣2, 蒋伏松2, 蒋燕燕2, 李鸣2, 李甜甜2, 刘婵薇2, 陈亚婷2, 刘丽梅,2

1.黄淮学院医学院形态学教研室,驻马店 463000

2.上海交通大学医学院附属第六人民医院内分泌代谢科,上海市糖尿病研究所,上海 200233

3.上海交通大学医学院附属同仁医院内分泌代谢科,上海 200336

Screening and functional analysis of mutations in NEUROD1 gene in pedigrees of maturity-onset diabetes of the young

ZHANG Juan,1, GE Xiaoxu2,3, ZHANG Rong2, JIANG Fusong2, JIANG Yanyan2, LI Ming2, LI Tiantian2, LIU Chanwei2, CHEN Yating2, LIU Limei,2

1.Department of Morphology, School of Medicine, Huanghuai University, Zhumadian 463000, China

2.Department of Endocrinology and Metabolism, Shanghai Sixth People's Hospital, Shanghai Jiao Tong University School of Medicine, Shanghai Diabetes Institute, Shanghai 200233, China

3.Department of Endocrinology and Metabolism, Tongren Hospital, Shanghai Jiao Tong University School of Medicine, Shanghai 200336, China

通讯作者: 刘丽梅,电子信箱:lmliu@sjtu.edu.cn

编委: 吴洋

收稿日期: 2023-08-13   接受日期: 2023-09-22   网络出版日期: 2023-10-28

基金资助: 河南省科技攻关项目.  212102310764
国家自然科学基金.  81970686.  81770791

Corresponding authors: LIU Limei, E-mail:lmliu@sjtu.edu.cn.

Received: 2023-08-13   Accepted: 2023-09-22   Online: 2023-10-28

作者简介 About authors

张娟(1989—),女,讲师,博士;电子信箱:839329711@qq.com。 E-mail:839329711@qq.com

摘要

目的·筛查青少年的成人起病型糖尿病(maturity-onset diabetes of the young,MODY)家系中NEUROD1基因突变,分析突变与中国人MODY6发病的相关性及其潜在的致病机制。方法·采用PCR-直接测序法对96例GCK/MODY2、HNF1A/MODY3、HNF1B/MODY5突变阴性的中国MODY先证者进行NEUROD1突变筛查,同时比较96例MODY先证者与100例非糖尿病对照者NEUROD1基因变异的基因型频率。采用从头建模法构建NEUROD1蛋白野生型和突变体的3D结构,采用双荧光素酶报告基因系统检测野生型和突变体蛋白对胰岛素基因转录活性的影响。结果·在一个MODY家系中发现NEUROD1基因杂合错义突变Glu59Gln(NM_002500.5,c.175G>C)。3D结构分析发现,该突变将野生型中带负电荷的Glu59转化为突变中不带电荷的Gln59,导致两个盐桥键Glu59-Arg54和Glu59-Lys88缺失,并形成一个新的氢键Gln59- Arg54。与野生型相比,Glu59Gln突变体的胰岛素基因转录活性下降36.3%(P<0.05)。与非糖尿病对照相比,96例MODY先证者中Ala45Thr(G-A)变异的AA+GA基因型频率显著升高(P=0.002)。结论·Glu59Gln突变改变了NEUROD1蛋白N端的分子构象,导致其胰岛素基因转录活性显著下降,是该家系突变携带者胰岛素分泌缺陷的原因。Ala45Thr变异与MODY6先证者糖尿病发病年龄的提前有关。

关键词: 青少年的成人起病型糖尿病 ; NEUROD1基因 ; MODY6 ; Glu59Gln突变 ; 功能解析

Abstract

Objective ·To screen the mutations of NEUROD1 gene in families of maturity-onset diabetes of the young (MODY), and investigate the correlation between the mutation and MODY6 and its potential pathogenesis in Chinese. Methods ·PCR-direct sequencing was used for screening NEUROD1 mutations from 96 MODY probands who were negative for mutations in the GCK/MODY2, HNF1A/MODY3 and HNF1B/MODY5 genes, and the genotypic frequency of NEUROD1 variations were compared between the 96 MODY probands and 100 non-diabetic control subjects. A de novo modeling method was used to predict the three-dimensional (3D) structures of wild type (WT) and mutated NEUROD1 proteins. Transcriptional activities of both WT and mutant of NEUROD1 on insulin gene were detected by using dual luciferase reporter gene system. Results ·Glu59Gln (NM_002500.5, c.175G>C), a heterozygous missense mutation in the NEUROD1 gene, was identified in a MODY pedigree. 3D structural analysis showed that the mutation transformed the negatively charged Glu59 of WT into uncharged mutation Gln59, leading to the loss of Glu59-Arg54 and Glu59-Lys88, two salt bridge bonds, and the formation of Gln59-Arg54, one new hydrogen bond. Transcriptional activity of Glu59Gln mutant for insulin gene was reduced by 36.3% when compared with that of WT (P<0.05). A common variation Ala45Thr (G-A) was identified, and AA+GA genotypic frequency of the variation was significantly elevated in the 96 MODY probands in comparison to non-diabetic control subjects (P=0.002). Conclusion ·Glu59Gln mutation alters the N-terminal molecular conformation of NEUROD1 protein, resulting in decreased transcriptional activity of insulin gene, which is the cause of the defective insulin secretion in mutation carriers of the MODY6 pedigree. The Ala45Thr variation is associated with earlier age of onset of diabetes in MODY6 probands.

Keywords: maturity-onset diabetes of the young (MODY) ; NEUROD1 gene ; MODY6 ; Glu59Gln mutation ; functional analysis

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本文引用格式

张娟, 葛晓旭, 张荣, 蒋伏松, 蒋燕燕, 李鸣, 李甜甜, 刘婵薇, 陈亚婷, 刘丽梅. 青少年的成人起病型糖尿病家系NEUROD1基因突变的筛查与功能解析. 上海交通大学学报(医学版)[J], 2023, 43(10): 1255-1261 doi:10.3969/j.issn.1674-8115.2023.10.005

ZHANG Juan, GE Xiaoxu, ZHANG Rong, JIANG Fusong, JIANG Yanyan, LI Ming, LI Tiantian, LIU Chanwei, CHEN Yating, LIU Limei. Screening and functional analysis of mutations in NEUROD1 gene in pedigrees of maturity-onset diabetes of the young. Journal of Shanghai Jiao Tong University (Medical Science)[J], 2023, 43(10): 1255-1261 doi:10.3969/j.issn.1674-8115.2023.10.005

NEUROD1蛋白又名BETA2,是一种碱性螺旋-环-螺旋(basic helix-loop-helix,bHLH)转录因子,不仅调节内分泌胰腺发育,而且与细胞中广泛存在的bHLH蛋白E47结合形成异源二聚体,作用于胰岛素启动子,激活胰岛素基因表达1。在胰岛素基因转录中起主导作用的NEUROD1能够与转录因子PDX1MafA相互作用,协同激活胰岛β细胞中的胰岛素基因2。除胰岛素基因外,NEUROD1还激活青少年的成人起病型糖尿病(maturity-onset diabetes of the young,MODY)其他相关基因,如ABCC8/MODY12、GCK/MODY2和转录因子基因PAX6,从而间接调节胰岛素基因的转录和表达3

NEUROD1失活导致小鼠和人类发生糖尿病。靶向破坏小鼠NeuroD1双等位基因导致小鼠发展为严重的糖尿病,并在围生期死亡;同时观察到胰岛β细胞数量显著减少、胰岛发育不成熟,表明NEUROD1对正常胰岛结构的形态发生至关重要4。研究1发现,NeuroD1为功能性α和β细胞分化所必需,因小鼠NeuroD1缺失改变了α和β细胞的特性(包括α和β细胞分化、β细胞增殖、胰岛素产生和胰岛形成的关键转录因子的表达),最终导致严重的新生小鼠糖尿病。人类胚胎干细胞(human embryonic stem cells,HESCs)的研究5发现,HESCs中NEUROD1失活导致β细胞转录网络无法激活,以致其无法分化为功能性β细胞。此外,人类NEUROD1杂合突变导致MODY6亚型6,而纯合突变导致表型更为严重的永久性新生儿糖尿病7。而且,NEUROD1基因Ala45Thr多态与2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)显著相关,特别是在亚洲人群中8-9

GCK/MODY2和HNF1A/MODY3不同,NEUROD1/MODY6非常少见。迄今为止,报道了约20种NEUROD1基因突变与MODY6亚型相关,且主要是高加索人群的突变(人类基因突变数据库:https://www.hgmd.cf.ac.uk/ac/index.php),在亚洲人中则鲜有报道10NEUROD1基因突变非常罕见,可能是由于突变表型的不完全外显而导致其被忽视。本研究对96例GCK/MODY2、HNF1A/MODY3、HNF1B/MODY5基因阴性的中国MODY先证者进行NEUROD1突变筛查,并对鉴定出的突变进行结构和功能解析,探讨突变与临床表型的遗传-共分离,同时分析NEUROD1基因Ala45Thr多态与MODY先证者发病的相关性。

1 对象与方法

1.1 研究对象

2018—2021年96例不相关MODY先证者及其家庭成员被转诊或招募到上海交通大学医学院附属第六人民医院糖尿病研究所,并所进行标准化临床特征评估和NEUROD1基因突变筛查。96例MODY先证者符合以下标准:①发病年龄<25岁。②糖尿病家族史≥3代。③胰岛β细胞抗体阴性。④GCK/MODY2、HNF1A/MODY3、HNF1B/MODY5突变阴性。此外,从该医院体检中心招募100名无血缘关系的非糖尿病对照受试者(年龄≥60岁,无糖尿病家族史,糖耐量正常)。通过口服葡萄糖耐量试验(oral glucose tolerance test,OGTT)检测非糖尿病对照受试者的糖耐量,同时满足以下3个标准则判定为糖耐量正常11:①空腹血糖<5.6 mmol/L。②餐后2 h血糖<7.8 mmol/L。③糖化血红蛋白<5.7%。

1.2 遗传分析

使用Qiagen试剂盒(Qiagen,德国)从外周血白细胞或唾液中提取受试者的基因组DNA。应用PCR-直接测序和多重连接依赖探针扩增技术(multiplex ligation-dependent probe amplification,MLPA)筛查样本中的NEUROD1突变。使用3对引物检测该基因的编码序列以及NEUROD1的侧翼序列10。Sanger测序用于检测筛出的突变与家族其他成员高血糖的共分离情况。

1.3 生物信息学分析

使用Clustal O(https://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalo/)对来自不同物种的NEUROD1蛋白的特定区域进行比对,以评估物种间的保守性。应用SIFT、Polyphen-2和MutationTaster软件预测突变的有害、致病性。此外,由于蛋白质晶体结构数据库中没有NEUROD1的晶体结构和相似性很高的同源蛋白,采用从头建模方法预测野生型NEUROD1和突变体的三维结构12

1.4 双荧光素酶报告基因系统检测

将人胰岛素启动子区域亚克隆至pGL3-质粒(美国Promega公司)构建报告基因载体。使用 QuikChange®定点诱变试剂盒将Glu59Gln突变引入小鼠NeuroD1(mNeuroD1)cDNA,并通过DNA测序进行验证。使用pcDNA3.3(+)、pcDNA3.3-mNeuroD1-WT和pcDNA3.3-mNeuroD1-Glu59Gln构建表达载体并转染到小鼠MIN6细胞,同时共转染pGL3-hINS启动子载体和作为内部对照的含有海肾荧光素酶基因的pRL-TK载体。转染后48 h收集细胞,并根据试剂盒说明书检测荧光素酶活性,每个实验重复3次。Western blotting用于检测转染的野生型NeuroD1和Glu59Gln突变蛋白的表达水平是否相等。

1.5 统计学方法

使用SPSS 28.0和GraphPad Prism 7.0软件对数据进行分析和处理。数据表示为x±s或中位数(四分位数间距)。组间定量资料比较采用t检验或单因素方差分析,偏态分布的数据在分析前进行对数变换。组间基因型及等位基因频率分布比较采用Fisher确切概率法或χ2检验。计算等位基因及相应基因型的OR值(95%CI)。P<0.05表示差异具有统计学意义。

2 结果

2.1 遗传分析

在一个MODY家系中鉴定出NEUROD1基因杂合错义突变Glu59Gln (NM_002500.5,c.175 G>C),通过Sanger测序基因分型发现,在100名非糖尿病对照者中不存在该突变。

在该家族中,先证者、先证者的儿子、先证者的1个哥哥和1个姐姐被证实携带该突变且为糖尿病患者,分别在25、12、30和33岁被诊断患有糖尿病;而先证者的父亲(63岁)虽然携带Glu59Gln突变,但OGTT结果显示其糖耐量正常;先证者的母亲56岁时被诊断为2型糖尿病但不携带该突变。Glu59Gln突变发生在NEUROD1蛋白的N端,E59在哺乳动物间高度保守(图1)。

图1

图1   NEUROD1 基因中Glu59Gln突变的鉴定

Note: A. Schematic organization of NEUROD1 protein. The numbers indicate the amino acids bordering the functional domains. Solid and dashed arrows indicate the identified mutation Glu59Gln and variation Ala45Thr in NEUROD1 gene, respectively. B. Alignment of specific regions of NEUROD1 from different mammals using Clustal O. C. DNA sequences of two genotypes of WT (Glu59Glu) and mutant (Glu59Gln) in NEUROD1.

Fig 1   Identification of Glu59Gln mutation in NEUROD1 gene


此外,与T2DM相关的NEUROD1基因Ala45Thr变异亦是MODY先证者的常见多态。与非糖尿病对照组相比,MODY先证者队列中AA+GA基因型频率显著增加(OR=3.6,95%CI 1.6~8.1,P=0.002),A等位基因频率亦显示相似增加趋势(OR=3.6,95%CI 1.7~7.9,P=0.001)(表1)。

表1   非糖尿病对照者与MODY先证者 NEUROD1 基因Ala45Thr变异的分布[n(%)]

Tab 1  Distribution of Ala45Thr variation in NEUROD1 gene between non-diabetic controls and MODY probands [n(%)]

GroupnFrequency of genotypesFrequency of alleles
AAGAGGAG
Non-diabetic control1000 (0)9 (9.0)91 (91.0)9 (4.5)191 (95.5)
MODY proband963 (3.1)22 (22.9)71 (74.0)28 (14.6)164 (85.4)

Note:P = 0.002, P=0.001, compared with non-diabetic controls.

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2.2 生物信息学分析

为了研究NEUROD1-Glu59Gln突变对蛋白质结构的影响,建立NEUROD1的3D结构模型,并进一步分析野生型Glu59和突变型Gln59与其周围氨基酸的相互作用(图2)。图2A和2B显示野生型Glu59和突变型Gln59在NEUROD1蛋白整体结构中的定位。带负电的野生型Glu59与周围带正电的Arg54和Lys88形成了强盐桥键,而Glu59的主链与Gly56和Asp61分别形成了氢键(图2C)。在Glu59Gln突变中,Glu59侧链的盐桥键被破坏,而突变的Gln59与Arg54形成了新的氢键(图2D)。此外,SIFT、Polyphen-2和MutationTaster软件预测结果显示Glu59Gln突变有害、致病。

图2

图2   NEUROD1野生型和Glu59Gln突变体的3D结构模型

Note: A/B. The location of wild type Glu59(A) and mutant Gln59(B) on the global landscape of NEUROD1 protein. C. Interaction of Glu59 with surrounding residues. The side chains of Glu59 formed strong salt bridge bonds with Arg54 and Lys88, and the main chains of Glu59 formed hydrogen bonds with Gly56 and Asp61, respectively. D. Interaction of Gln59 with surrounding amino acids. In the Glu59Gln mutation, the salt-bridge bonds of the side chains of Glu59 were disrupted, while the mutated Gln59 formed a new hydrogen bond with Arg54. Blue dotted lines represent salt bridge bonds formed between amino acids, while green dotted lines represent hydrogen bonds.

Fig 2   3D structural models of wild type and Glu59Gln mutant of NEUROD1 protein


2.3 转录活性

为了进一步评估Glu59Gln突变对蛋白功能的影响,使用双荧光素酶报告基因系统在小鼠胰岛β细胞(MIN6细胞)中分别检测了NeuroD1野生型和突变体的胰岛素基因转录活性。与pcDNA3.3-mNeuroD1-WT相比,pcDNA3.3-mNeuroD1-Glu59Gln的相对荧光素酶活性降低了36.3%(P<0.05)(图3A)。Western blotting结果显示在转染细胞中Glu59Gln突变体的表达水平与野生型NeuroD1相当(图3B),提示突变导致蛋白转录活性下降。

图3

图3   野生型和突变型NeuroD1蛋白的转录活性测定

Note:A. Relative luciferase activities of the human insulin promoter luciferase reporter gene stimulated by mNeuroD1-WT and mNeuroD1-Glu59Gln in MIN6 cells. B. Expression of mNeuroD1-WT-Flag and mNeuroD1-Glu59Gln-Flag by Western blotting assay in MIN6 cells. P=0.000,compared with NC; P=0.024, compared with mNeuroD1-WT. NC—pcDNA3.3.

Fig 3   Transcriptional activities of wild type and mutant of NeuroD1 protein


3 讨论

自1999年NEUROD1被报道为MODY6基因以来,我们曾在中国人群中报道了NEUROD1基因S159P突变和A45T变异9-10。2015年在印度的一个MODY家系中发现Glu59Gln突变,先证者在30岁时被诊断为糖尿病,但是没有对该突变进行结构-功能解析13。本研究在1个中国典型MODY家系中首次发现Glu59Gln突变。先证者的突变遗传自其糖耐量正常的父亲,这也是中国MODY家系中首次报道的NEUROD1基因突变的不完全外显遗传。通过构建3D模型发现,突变导致其与周围氨基酸的相互作用发生了改变,并且体外实验证实突变体的胰岛素基因的转录活性显著下降。这些结果提示,突变蛋白的结构变化导致的功能降低,支持了Glu59Gln突变在该不完全外显遗传家系糖尿病发病中的作用。

3.1 NEUROD1 基因突变的临床特点和不完全外显遗传

NEUROD1-Glu59Gln突变在该中国MODY家族中表现为不完全外显遗传,其他种族的研究也支持MODY6基因突变呈现这种遗传方式14-16NEUROD1-H241Q突变的2个捷克MODY家系研究发现,4个非糖尿病个体(年龄4~30岁)携带该突变,提示不完全外显可能与他们的年龄较小有关14。此外,冰岛MODY研究15显示,NEUROD1-E110K突变引起的糖尿病发病年龄最高者为68岁,而日本研究中由NEUROD1-H206PfsTer38突变导致的糖尿病发病年龄最高为76岁16。这些NEUROD1突变携带者发生糖尿病的年龄范围很广,从童年到成年晚期均有,支持了MODY6的不完全外显。此外,FAJANS等17指出,在多代MODY家系中,较年轻一代的糖尿病发病年龄较早。根据以上结果可以推测,本研究中先证者的父亲虽然在63岁时尚未发病,但不能排除晚年患糖尿病的可能性。本研究中先证者的母亲并没有携带该突变,根据其临床表型和实验室检测结果诊断为T2DM。这导致当我们使用经典的MODY诊断标准招募先证者和家庭成员时,这个“三代糖尿病家族史”也被纳入研究设计中。因此,在中国人群中使用“宽松”的MODY标准,即连续2代糖尿病患者和1例25岁前诊断为糖尿病的患者,可以识别出更多的MODY6患者。

3.2 N端突变改变了NEUROD1蛋白的3D结构

人类NEUROD1基因包含2个外显子,定位于染色体2q32,编码的蛋白包括1个N端区域、1个bHLH结构域和1个C端反转录激活结构域。虽然bHLH结构域对于E47二聚化和DNA结合至关重要,但缺少N端或C端的NEUROD1蛋白激活INS启动子的能力明显降低,提示N端或C端对NeuroD1蛋白发挥转录激活作用的重要性3。本研究发现的Glu59Gln突变位于NEUROD1蛋白的N端,并且Glu59残基在哺乳动物物种中高度保守,这表明该残基的替换(突变)可能致病。通过构建野生型和突变的NeuroD1蛋白的三维结构,我们发现在Glu59Gln突变中,带负电的Glu59残基被不带电Gln59残基所取代。负电荷的丢失导致Gln59与周围氨基酸之间的相互作用减弱,即盐桥键(Glu59-Arg54和Glu59-Lys88)丢失和新氢键(Gln59-Arg54)形成。N端局部构象改变使突变体结构不稳定,可能进一步导致了突变蛋白的功能受损。

3.3 Glu59Gln突变降低了NeuroD1蛋白的转录活性

本研究中双荧光素酶报告基因检测结果显示,NeuroD1蛋白N端Glu59Gln突变对胰岛素基因的转录活性比野生型下降了36.3%。此外,我们在先前的研究10,即1个三代MODY家系中发现NEUROD1蛋白C端(156aa-356aa)Ser159Pro突变,突变导致蛋白转录活性下降25%。我们的研究结果支持了N端或C端对NEUROD1蛋白发挥转录激活作用的重要性3。一项高加索人群研究15报道了NEUROD1蛋白DNA结合结构域突变(Arg111Leu)和反转录激活结构域突变(206+C),而这些突变导致了更严重的转录活性降低(分别为80%和72%)。综合以上研究结果,不同位点突变对功能影响的差异,可以解释本研究Glu59Gln突变的MODY家族与其他NEUROD1基因突变的MODY家族之间糖尿病临床表型严重程度的不同。

3.4 NEUROD1 基因Ala45Thr多态促进MODY先证者发病

本研究在MODY先证者中亦发现了Ala45Thr多态。与非糖尿病对照相比,Ala45Thr多态使MODY先证者的糖尿病发病风险增加了2.6倍,这与早发T2DM的研究结果相似918。一项meta分析结果8表明,NEUROD1基因Ala45Thr多态性与T2DM发病显著相关,而且这种相关性在亚洲人群中尤为明显;这不仅支持了我们的结果,还体现了该多态在糖尿病发病中的种族异质性。我们先前的研究918发现,NEUROD1基因Ala45Thr多态主要与具有家族史的早发T2DM发病相关,而MODY(发病年龄小于25岁)是早发T2DM(发病年龄小于40岁)的特殊类型,发病年龄更早。因此我们认为,携带NEUROD1基因Thr45等位基因可能使中国MODY先证者的糖尿病发病年龄早于传统定义上的早发T2DM。

综上所述,我们在一个中国典型MODY家族中发现NEUROD1基因Glu59Gln突变。NEUROD1- Glu59Gln突变显著影响59号氨基酸残基与其周围氨基酸的相互作用,从而改变了NEUROD1蛋白N端分子构象;构象的改变导致Glu59Gln突变体的胰岛素基因转录活性显著下降,从而导致胰岛素分泌缺陷的MODY6亚型的发生。此外,Ala45Thr变异促进了MODY先证者的发病并使携带者糖尿病发病年龄提前。

作者贡献声明

刘丽梅负责研究方案设计及论文审定,张娟和葛晓旭负责论文撰写,张荣、蒋伏松、蒋燕燕、李鸣、李甜甜、刘婵薇和陈亚婷参与了数据收集与分析。所有作者均阅读并同意了最终稿件的提交。

LIU Limei designed the study and finalized the draft. ZHANG Juan and GE Xiaoxu wrote the paper. The data was collected and analyzed by ZHANG Rong, JIANG Fusong, JIANG Yanyan, LI Ming, LI Tiantian, LIU Chanwei and CHEN Yating. All the authors have read the last version of paper and consented for submission.

利益冲突声明

所有作者声明不存在利益冲突。

All authors disclose no relevant conflict of interests.

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