上海交通大学学报(医学版), 2024, 44(11): 1439-1446 doi: 10.3969/j.issn.1674-8115.2024.11.011

综述

长寿蛋白SIRT6在衰老和代谢中作用的研究进展

刘永慧,1, 唐莉1, 梁泰刚1, 张健,2, 冯丽,2

1.山西医科大学药学院,太原 030001

2.上海交通大学医学院药物化学与生物信息中心,上海 200025

Research progress in the role of SIRT6 in aging and metabolism

LIU Yonghui,1, TANG Li1, LIANG Taigang1, ZHANG Jian,2, FENG Li,2

1.School of Pharmacy, Shanxi Medical University, Taiyuan 030001, China

2.Medicinal Chemistry and Bioinformatics Center, Shanghai Jiao Tong University School of Medicine, Shanghai 200025, China

通讯作者: 冯 丽,电子信箱:fengli2020@sjtu.edu.cn张 健,电子信箱:jian.zhang@sjtu.deu.cn为共同通信作者。

编委: 徐敏

收稿日期: 2024-06-05   接受日期: 2024-06-11   网络出版日期: 2024-11-28

基金资助: 国家重点研发计划.  2023YFF1205103

Corresponding authors: FENG Li, E-mail:fengli2020@sjtu.edu.cnZHANG Jian, E-mail:jian.zhang@sjtu.edu.cn.

Received: 2024-06-05   Accepted: 2024-06-11   Online: 2024-11-28

作者简介 About authors

刘永慧(1999—),女,硕士生;电子信箱:QLiuYongHui@163.com。 E-mail:QLiuYongHui@163.com

摘要

SIRT6是组蛋白去乙酰化酶第三家族长寿蛋白中的一员,具备依赖于烟酰胺腺嘌呤二核苷酸的脱酰基酶活性和单ADP核糖基转移酶活性。SIRT6主要位于细胞核内,可通过核心调控基因组稳定性和相关基因表达,参与控制机体能量代谢和衰老在内的关键过程。鉴于其在维持细胞稳态和机体健康中的关键作用,SIRT6作为潜在的药物靶点引起人们对其靶向调节剂开发广泛的研究兴趣。药物激动长寿蛋白的活性可能治疗与年龄相关的疾病,如衰老、代谢综合征、炎症和生殖健康等。该文综述了SIRT6的结构特征、酶活性、生物学功能,以及SIRT6激动剂的作用机制、药理活性和临床应用。

关键词: SIRT6 ; 去乙酰化酶活 ; 衰老 ; 代谢 ; 炎症 ; 药物发现

Abstract

SIRT6, a member of the sirtuin family of histone deacetylases, belongs to the class Ⅲ longevity proteins and exhibits NAD+-dependent deacetylase and mono-ADP-ribosyltransferase activities. SIRT6 is primarily located in the cell nucleus and plays a pivotal role in regulating genomic stability and relative gene expression, participating in the control of key processes such as energy metabolism and aging. Given its crucial role in maintaining cellular homeostasis and organismal health, SIRT6 has emerged as a potential therapeutic target, sparking significant research interest in the development of targeted modulators. Activating the longevity protein with drugs may provide therapeutic strategies for age-associated diseases, including aging, metabolic syndrome, inflammation, and reproductive health issues. The review elaborates the structural characteristics, enzymatic activities, and biological functions of SIRT6, as well as the mechanisms of action, pharmacological activities, and clinical applications of various SIRT6 activators.

Keywords: SIRT6 ; catalytic activity ; aging ; metabolism ; inflammation ; drug discovery

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本文引用格式

刘永慧, 唐莉, 梁泰刚, 张健, 冯丽. 长寿蛋白SIRT6在衰老和代谢中作用的研究进展. 上海交通大学学报(医学版)[J], 2024, 44(11): 1439-1446 doi:10.3969/j.issn.1674-8115.2024.11.011

LIU Yonghui, TANG Li, LIANG Taigang, ZHANG Jian, FENG Li. Research progress in the role of SIRT6 in aging and metabolism. Journal of Shanghai Jiao Tong University (Medical Science)[J], 2024, 44(11): 1439-1446 doi:10.3969/j.issn.1674-8115.2024.11.011

组蛋白赖氨酸的乙酰化是一种由组蛋白乙酰转移酶催化的翻译后修饰,而去乙酰化反应则由组蛋白去乙酰化酶(histone deacetylase,HDAC)介导。根据进化分析以及与酵母中不同去乙酰化酶的序列相似性,HDAC可分为4类:Ⅰ类(HDAC 1~3、8)、Ⅱ类(HDAC 4~7、9、10)、Ⅲ类(sirtuins)和Ⅳ类(HDAC 11)1。Sirtuins是一类与酿酒酵母中的沉默信息调节蛋白SIR2(silent information regulator 2)同源且高度保守的蛋白。Sirtuins有依赖于烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(nicotinamide adenine dinucleotide,NAD+)的脱酰基酶活性和单ADP核糖基转移酶活性。哺乳动物sirtuins蛋白家族中包含7种同工酶(SIRT1~7)2。尽管sirtuins结构中含有NAD+结合位点且共享一个约包含275个残基的高度保守催化位点,但它们的N端延伸和C端延伸区域的大小和序列存在差异,这直接决定了其在细胞定位、催化酶活性、底物选择性和生物功能上的区别3。SIRT1、SIRT6和SIRT7主要定位于细胞核,参与调控基因稳定性和转录;SIRT2主要存在于胞质,可去乙酰化微管蛋白等胞质蛋白的乙酰化修饰;SIRT3~5主要位于线粒体,调控线粒体能量代谢相关通路4。研究5发现棕榈酸结合SIRT6后可使其穿梭到胞质中,催化长链脂酰辅酶A合成酶5(acyl-CoA synthetase long-chain family member 5,ACSL5)的去乙酰化,从而调控脂肪酸的氧化。近年来,关于SIRT6的结构特征、催化酶活性及相应的生物学功能也逐渐被阐明。

SIRT6中最显著的结构特征是连接锌指结构和 罗斯曼折叠结构域的α螺旋束被1个灵活的链取代,这使得SIRT6的去乙酰化酶活性弱于SIRT1,并获得独特的催化去长链脂肪酸酰化作用的能力6。SIRT6的特殊结构特征决定了其特异的生物学功能。SIRT6作为去乙酰化酶,可通过去乙酰化组蛋白3上的第9位乙酰化的赖氨酸(H3K9ac)、H3K56ac、H3K18ac来抑制下游基因的转录,从而介导端粒的保护和基因组稳定性,促进DNA修复,防止衰老7。此外,SIRT6还可特异性修饰一些非组蛋白底物,进一步丰富其生物学功能。例如,SIRT6可对PARP1[poly(ADP-ribose)polymerase 1]进行单ADP-核糖基化修饰,从而激活PARP1的多ADP核糖基活性;更有趣的是,SIRT6可以通过去除炎症因子TNF-α K19和K20位点上的脂肪酸酰化,促进TNF-α的释放6。因此,SIRT6可通过对组蛋白和非组蛋白的翻译后修饰来调节多种生物过程,包括衰老、糖脂代谢、炎症和生殖功能等。本文总结了SIRT6的结构特征,分析其催化活性与蛋白结构之间的关系,重点讨论SIRT6依赖于不同底物或互作蛋白介导的生物学功能,概述近期发现的与其上述功能最相关的SIRT6激动剂,以期能为深入理解SIRT6的功能和调节机制,为未来疾病治疗的新策略提供参考。

1 SIRT6的结构特征

人源SIRT6基因位于19号染色体的短臂13.3位置,是一个由8个外显子组成的单拷贝基因8。人源SIRT6蛋白分子由355个氨基酸残基组成,分子量为39 119,等电点为9.12。与其他长寿蛋白家族成员类似,SIRT6的结构可分为N端延伸区(N terminal extension,NTE)、C端延伸区(C terminal extension,CTE)、小结构域(含锌指结构)和罗斯曼折叠区域(图19。NTE和CTE的环区结构高度灵活且无序。NTE的Asp14-Phe24位于NAD+结合位点的上方,使NAD+结合口袋被氨基酸残基完全包围9。因此,NTE对去乙酰化酶活性和染色质结合至关重要。CTE则对于核小体DNA的识别和核定位十分关键9-10,因为该区域具有1个类似于核定位信号的序列(344-PKRVKAK-352),当该序列发生突变时,SIRT6将分布在细胞质中9-11

图1

图1   人源SIRT6蛋白的二级结构

Note: The structural composition of SIRT6 is basically divided into Rossmann fold structure, small structural domains (including the zinc finger module), C-terminal extension (CTE) and N-terminal extension (NTE). SIRT6 is shown as a purple cartoon structure with lake blue stick structures for NAD+ and green for ADP ribose.

Fig 1   Secondary structure of the human protein SIRT6


SIRT6的催化活性中心位于罗斯曼折叠域和小结构域之间的裂缝中,该结合域可容纳酰化赖氨酸底物和NAD+。独特的是,SIRT6是否结合乙酰化底物不影响蛋白与NAD+的结合能力6。SIRT6与NAD+之间的强结合源于其特殊的结构特征,即SIRT6 NAD+结合口袋包含1个有序的α3螺旋(图1),可产生1个不太灵活的口袋和稳定的构象12。Sirtuins的小结构域包含1个β-折叠模块和1个锌指模块。相较于其他长寿蛋白成员,SIRT6的β-折叠模块被1个灵活的loop结构取代,使得SIRT6小结构域呈现“开放”状态。此外,Arg124和Gln145之间的氢键将锌指模块和罗斯曼折叠区域连接,这是小结构域呈现开放构象的另一个原因6-13。这个结构特征可能是导致SIRT6去乙酰化活性远低于SIRT1的原因之一6。此外,开放构象使得小结构域和罗斯曼折叠交界处的催化活性中心形成1个狭长的疏水口袋,更适合容纳长链脂肪酰基底物。尽管Zn2+不直接参与SIRT6的去乙酰化反应过程,但可以维持具有催化活性的蛋白构象功能。SIRT6的锌指模块包含4个保守的半胱氨酸残基(Cys141、Cys144、Cys167、Cys178),这与其他长寿蛋白一致。然而,在SIRT6的Cys167-X10-Cys178之间有1个由10个氨基酸残基组成的基序插入,形成向外延伸的环14;该延伸环中Lys170残基的插入与SIRT6的稳定性直接相关,这在其他长寿蛋白中尚未发现。另外,SIRT6可以在Lys170被泛素连接酶CHIP非典型性泛素化,防止其他泛素连接酶对其泛素化,从而增加SIRT6的半衰期15

2 SIRT6去乙酰化活性

图2所示,当SIRT6的催化活性中心将乙酰化底物与NAD+结合时,NAD+空间构象会发生变化,烟酰胺基团会嵌入活性疏水口袋,并暴露其C1碳原子。乙酰基-赖氨酸的酰基氧会进攻核糖的C1位进行亲核加成反应,从而切断烟酰胺和核糖之间的糖苷键,形成C1′-O-烷基酰胺中间体和游离的烟酰胺。随后,催化活性中心的关键氨基酸保守型的His13316,促进核糖2′-OH攻击C1′-O-烷基酰胺中间体的亚胺碳基团,生成1,2-双环中间体。最后,不稳定的双环中间体被水解,生成脱乙酰的赖氨酸蛋白和O-酰基-ADP核糖17。因此,在SIRT6介导的赖氨酸去乙酰化反应中,会消耗一分子NAD+和乙酰化肽底物,催化产生去乙酰化肽底物、O-酰基-ADP核糖和烟酰胺。

图2

图2   SIRT6催化去酰化的分子机制

Note: NAD+ acts as a cofactor to assist SIRT6 in removing acylation groups from substrate lysine residues, resulting in the generation of NAM, ADP ribose, and the deacetylated product.

Fig 2   Mechanism of SIRT6 catalyzing deacylation


SIRT6体外体系中的去乙酰活性非常弱,催化速率大约只有其他sirtuins的千分之一。然而,它对包含DNA的完整核小体结构的乙酰化组蛋白具有很高的催化活性,这表明其高催化效率可能需要完整的生理环境中的染色质结构11。已知的SIRT6去乙酰化作用的底物有组蛋白和非组蛋白类型:组蛋白底物包括H3K9、H3K56、H3K18等10;非组蛋白底物有PARP和组蛋白乙酰转移酶GCN5(general control of amino acid synthesis protein 5)等18。SIRT6的去乙酰化活性在多种生理过程中发挥着重要作用,例如代谢、衰老、炎症等。

3 SIRT6的生物学功能

3.1 衰老

自从sirtuins被证明是长寿蛋白后,它们就备受关注。衰老是一个复杂的生物过程,涉及多个维度,包括生理功能和健康水平的下降、虚弱感增加及寿命缩短3。研究19表明,SIRT6全身性缺失会导致小鼠出现典型的早衰综合征,表现为皮下脂肪流失、基因组不稳定性、致死性低血糖等症状,断奶后即死亡。这首次揭示了SIRT6在调节哺乳动物寿命方面的重要作用。研究20发现,SIRT6的过表达可以改善小鼠能量稳态并显著延长其寿命。事实上,SIRT6的寿命调控作用是一个极其复杂的过程,其中经历了多种生物过程的共同调控,如维持基因组稳定性和代谢稳态。越来越多的证据表明,DNA修复效率低下和DNA修复突变体是导致基因组不稳定性的主要原因,并最终加速衰老表型。相比之下,长寿物种的非同源末端连接(non-homologous end-joining,NHEJ)和同源重组(homologous recombination,HR)对双链断裂修复(double-strand break,DSB)的修复效率比短寿命物种更高21。令人更惊讶的是,在对18种不同寿命的啮齿动物进行比对后发现,SIRT6促进DSB修复的能力与寿命直接相关,SIRT6活性越高,则寿命越长21。SIRT6作为HR和NHEJ的上游调控因子,可以同时激活HR和NHEJ,从而提高修复效率和准确性22。另外,SIRT6还可以通过去乙酰化H3K9ac和H3K56ac实现端粒的正确复制。SIRT6的敲除导致端粒结构异常以及随机复制相关端粒序列丢失,最终导致基因组的不稳定性和细胞过早衰老23。能量限制可以通过抑制雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin,mTOR)-胰岛素样生长因子1(insulin-like growth factor 1,IGF1)通路,以及激活AMPK和sirtuins相关通路来延长寿命。研究24发现,SIRT6全身敲除导致的早衰缺陷主要与丝氨酸/苏氨酸激酶1-胰岛素样生长因子1(serine/threonine kinase-insulin like growth factor 1,AKT-IGF1)信号转导通路的增强相关。另外,SIRT6过表达可以降低小鼠血清中的IGF1水平,通过增加肝脏糖异生基因的表达和促进NAD+从头合成来维持老年鼠的能量稳态,从而实现延长30%左右的寿命25。总而言之,SIRT6可通过调节DNA损伤修复、端粒活性以及能量代谢等多个生物过程来共同调控衰老。

值得注意的是,SIRT6对灵长类和啮齿类动物的寿命调控存在差异性。虽然两者在SIRT6的NTE和活性结构区域具有高度相似性,但在小鼠SIRT6的CTE区域缺失了由4个残基和17个残基组成的2个片段;CTE的结构差异可能导致种属之间的功能差异26。SIRT6作为食蟹猴大脑发育过程中参与神经祖细胞分化的介质或因子,它的缺失会延迟食蟹猴的神经元成熟,导致全身发育出现严重缺陷,并在出生后数小时内死亡。尽管研究27表明SIRT6参与维持小鼠的基因组稳定性,然而食蟹猴体内SIRT6的缺失并未加重基因组不稳定。SIRT6基因的遗传突变会对人类寿命产生差异化影响。人源SIRT6 CTE富含多样性的突变,加强与Lamin A的相互作用,可通过平衡ADP核糖基转移酶活和去乙酰化酶活,促进DNA修复和LINE-1反转录转座子沉默改善基因组紊乱28。然而,SIRT6基因中位于rs117385980位点的T等位基因突变与芬兰男性的寿命呈负相关28SIRT6 D63H突变导致胎儿严重的先天性异常和围产期致死29。这些研究结果揭示了SIRT6在衰老和生物健康中的复杂调控机制。当然,SIRT6在不同种属之间调控差异的机制还有待更进一步探索。

3.2 糖脂代谢

3.2.1 脂代谢

现代医学强调肝脏在代谢中的关键作用,特别是在葡萄糖和脂肪的代谢平衡中,以维持机体的稳态。当热量摄入过多时,肝脏通过脂质合成途径将多余的葡萄糖转化为脂滴进行储存;而在禁食条件下,肝脏通过脂肪分解或脂肪酸氧化途径将储存的脂肪转化为可用能量。研究30发现,肝脏特异性缺失SIRT6导致小鼠无论禁食还是进食状态下,糖酵解和三酰甘油合成均显著增加,肝脏内葡萄糖激酶(glucokinase,GK)和参与三酰甘油合成的限速酶的表达量均显著上升,最终小鼠出现严重的脂肪变性。从机制来说,SIRT6可直接去乙酰化过氧化物酶体增殖物激活受体(peroxisome proliferator activated receptor,PPAR)共激活因子(nuclear receptor coactivator 2,NCOA2),增强PPAR的转录活性,上调脂肪酸氧化相关基因的表达,促进脂肪酸的分解利用,减少脂质堆积31。SIRT6通过与叉头盒蛋白O3(forkhead box O3,FOXO3)相互作用,去乙酰化其下游靶基因Pcsk9(proprotein convertase subtilisin/kexin type 9)启动区域的H3K9和H3K56ac,从而抑制Pcsk9的转录,影响低密度脂蛋白的稳态32。SIRT6可催化固醇调节元件结合蛋白1/2(sterol regulatory element binding transcription factor 1/2,SREBP1/2)调控的靶基因启动子区域H3K9ac和H3K56ac的去乙酰化,抑制活性SREBP1/2的产生和下游基因的转录,从而调节胆固醇和脂肪代谢33。有研究5发现,棕榈酸可以促进核内SIRT6与核转运受体(exportin 2,EXP2)相互作用并帮助其转位至细胞质中,细胞质内的SIRT6可直接催化去乙酰化蛋白ACSL5,促进脂肪酸氧化并抑制脂质积累,影响非酒精性脂肪肝病的进程。

3.2.2 糖代谢

SIRT6是维持糖代谢平衡的重要调节因子,可通过多种通路维持葡萄糖稳态。小鼠模型中SIRT6的缺失会激活IGF-1信号通路,导致糖酵解的代偿性增加和严重的低血糖24。另外,SIRT6通过去乙酰化低氧诱导因子α(hypoxia inducible factor 1 α,HIF1α)的靶基因丙酮酸脱氢酶激酶4(pyruvate dehydrogenase kinase 4,Pdk4)启动子区域的 H3K9ac和H3K56ac,抑制其转录,维持线粒体氧化磷酸功能所需的适当葡萄糖循环量,有效调节糖酵解34。PGC-1α是调节糖异生的关键转录共激活因子。GCN5通过调节PGC-1α的乙酰化状态来抑制其转录活性,从而干扰肝脏的糖异生。SIRT6通过去乙酰化GCN5的Lys549位点,增强GCN5的乙酰化活性,从而抑制肝脏糖异生,维持血糖稳定35。FOXO1作为调控糖异生的关键转录因子,可以调控糖异生限速酶葡萄糖-6-磷酸酶(glucose-6-phosphatase,G6PC)和磷酸烯醇丙酮酸羧激酶1(phosphoenolpyruvate carboxykinase-1,PEPCK-1)的转录。SIRT6通过调节肝脏内FOXO1的活性,抑制其下游靶基因的转录,从而影响糖异生过程36;另外在胰岛β细胞中,SIRT6也可通过去乙酰化 FOXO1,增加下游PDX1(pancreatic and duodenal homeobox 1)和葡萄糖转运蛋白2(glucose transporter-2,GLUT-2)的表达,进而提高胰岛β细胞的葡萄糖敏感性和全身葡萄糖耐受能力36。SIRT6调节糖代谢的能力决定了其在调节寿命、糖尿病和癌症中的重要作用。

3.3 炎症

过度或持续的炎症反应可能导致组织损伤和慢性疾病,SIRT6在炎症反应的调节中具备核心作用37-38。核因子κB(nuclear factor-κB,NF-κB)是炎症信号通路中的关键枢纽,其过度激活会导致TNF-α等炎症因子的释放39。SIRT6可以通过多种途径抑制NF-κB通路的激活:① SIRT6直接去乙酰化NF-κB p65亚基的Lys310和Lys632位点,抑制NF-κB的转录活性,从而下调下游炎症因子的转录40。② SIRT6通过去乙酰化NF-κB靶基因启动子区域的H3K9ac来抑制基因转录41。③ SIRT6可以通过去乙酰化IKKβ亚基来抑制IKK复合体的活性,从而阻止NF-κB的磷酸化和核转运。SIRT6通过去乙酰化其启动子区域的H3K9ac,来降低肿瘤坏死因子超家族成员4(tumor necrosis factor ligand superfamily member 4,TNFSF4)的表达,参与内皮激活和动脉粥样硬化病变的负调节42。在巨噬细胞中,SIRT6 还可通过抑制NF-κB转录活性,干扰NF-κB和信号转导与转录激活因子3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)之间的正反馈,进而抑制促炎症极化43-44

3.4 生殖健康

SIRT6在生殖健康中扮演着关键角色。在雌性动物中,卵巢是产生卵母细胞和分泌类固醇激素的关键器官,卵泡的数量和质量直接影响卵巢的功能45。研究46表明,SIRT6能够维持卵母细胞减数分裂过程中纺锤体和染色体的正常组装,从而改善卵母细胞的质量。热量限制介导SIRT6蛋白的表达上调,进而能够维持成年大鼠的卵泡储备并延缓卵巢衰竭47。全身性SIRT6敲除小鼠表现出卵巢发育停滞,卵巢雌激素受体表达降低和血浆雌激素水平下降,说明SIRT6在卵巢发育和胶原形成中具有重要作用48。SIRT6在子宫内膜中的表达参与调节人类生殖过程49,包括对体外受精期后的卵母细胞成熟和临床妊娠进程的调控50。SIRT6在睾丸组织中,尤其是在精子细胞的细胞核和成熟精子的顶体中高表达,进而影响精子的发育和成熟过程51。研究52发现,肥胖会降低男性精子中SIRT6的表达量,增加了精子细胞中活性氧(reactive oxygen species,ROS)和DNA损伤程度,最终影响精子的活性和功能。相反,过表达SIRT6能够通过减少精子中ROS的累积,从而降低氧化应激,这有助于改善精子质量以延长男性寿命45。总体来看,SIRT6在维持生殖系统稳态和功能中具有关键作用。

4 SIRT6激动剂

SIRT6的过表达或激活可以通过多种调控通路增强生物体健康稳态。因此,SIRT6激动剂可能在增强健康寿命方面发挥重要作用。然而,SIRT6过表达对延长寿命的机制尚未完全明了,SIRT6的多种酶活性与寿命延长的关系也不完全清楚。此外,SIRT6激动剂的发现仍处于初期阶段,开发以SIRT6为靶点的抗衰老药物需要基于完善的生化活性和机制研究。在此,我们总结了一些靶向SIRT6的激动剂及其研究进展。

4.1 天然激动剂

厚朴酸可通过促进SIRT6的表达、抑制NF-κB信号通路有效发挥治疗骨关节炎的作用53。橙皮素可通过调节TLR/MyD88/NF-κB信号通路抑制脂多糖/高糖诱导的炎症反应,是潜在的抑制糖尿病炎症的药物54。人参皂苷Rc可通过增加SIRT6的去乙酰酶活性,提高核转录因子红系2相关因子2(nuclear factor erythroid 2-related factor 2,NRF2)的稳定性,有效缓解氧化应激来治疗酒精性肝病55。枇杷叶中总倍半萜糖苷可通过调节IRS-1/GLUT4、瞬时受体电位阳离子通道亚家族V成员1(transient receptor potential cation channel subfamily V member 1,RPV1)和SIRT6/NRF2信号通路来改善高脂饮食诱导的胰岛素抵抗和糖脂代谢56-57。此类激动剂的研究主要集中在特异靶向性激动剂被开发之前,为理解SIRT6作为药物靶点的功能并进行验证提供了基础。

4.2 合成类激动剂

UBCS039(图3A)是最早报道的合成类SIRT6激活剂。体外酶活体系下,100 μmol/L UBCS039可将SIRT6去乙酰化活性提高至3.5倍,EC50值为38 μmol/L,对SIRT1~3的选择性高于SIRT5。SIRT6与UBCS039的共晶结构(图3B)显示,该小分子位于酰基通道的末端,这通常是酰基化底物的脂肪酰基链所占据的位置。UBCS039的三环母核可与Y71、F82、F86、I185和M157形成疏水相互作用,其吡啶氮与P62骨架羰基形成关键氢键,而属于喹啉核心的苯环则暴露在溶剂中。此外,100 μmol/L UBCS039可通过增加人宫颈癌HeLa细胞内的SIRT6去乙酰化活性,减少全长组蛋白和HeLa细胞核小体的H3K9/K56的乙酰化,并在纤维肉瘤、上皮宫颈癌、结直肠癌和非小细胞肺癌等不同癌细胞系中刺激自噬驱动的凋亡58-59

图3

图3   SIRT6 激动剂的化学结构和结合模式

Note: A. Chemical structures of SIRT6 agonist, MDL-800, MDL-801, and UBCS039. B. The binding modes of MDL-801 or UBCS039 with SIRT6. MDL-801 and UBCS039 are shown in green and blue sticks, respectively.

Fig 3   Structure and binding modes of SIRT6 activators


本课题组通过对SIRT6变构位点筛选了超过500万个化合物,发现了首个潜在的特异性SIRT6变构激动剂60。随后对其进行结构优化,最终获得了2个潜在的候选分子MDL-800和MDL-801(图3A)60-62。多项生化研究证明MDL-800和MDL-801通过促进NAD+与乙酰化肽底物(RHKK-ac)的结合,可将SIRT6的去乙酰化活性提高22倍,催化活性EC50分别为10.3 μmol/L和5.7 μmol/L。与UBCS039相比,MDL-800对HDAC家族表现出更高的选择性。从结构机制上来看,SIRT6与肉豆蔻酰肽、ADP-核糖和MDL-801的共晶结构表明,该分子结合在酰基结合通道的远端区域,这不同于UBCS039的结合口袋(图3B)。MDL-800靶向激活SIRT6后引发的生物学效应,已经在多种癌症模型、衰老、肝脏纤维化相关模型中表现出治疗效果。在肝癌细胞系中,MDL-800可浓度依赖式减少H3K9和H3K56的乙酰化,诱导其细胞周期停滞在G0-G1期,并能够停止肝癌细胞系的增殖。体内表型中,MDL-800在肝癌等异种移植小鼠模型中抑制了肿瘤的生长。此外,研究63表明,MDL-800能减少糖尿病小鼠的舒张功能障碍和心脏脂质积累,并在小鼠模型中发挥抗炎、促血管生成和伤口愈合作用。通过靶向递送系统将MDL-800定位于肝星状细胞,可以激活SIRT6,在一定程度上减少肝纤维化64。MDL-800还可以通过激活上述2种DEP通路,包括NHEJ和碱基切除修复,在老年小鼠来源的诱导性多能干细胞(induced pluripotent stem cell,iPSC)中改善基因组稳定性65

5 总结与展望

SIRT6作为一种重要的表观遗传调控酶,具有多样化的生物学功能。它可以通过多效的酶催化活性调控基因组稳定性、糖脂代谢、炎症反应和衰老过程。近年来,SIRT6的基本结构特征、催化去乙酰化酶活性的机制和底物的确定及其生物学功能逐渐被阐明,进一步揭示了其在细胞稳态和机体健康中的关键作用。SIRT6的激活剂开发也逐渐成为研究热点,这些激活剂有望成为治疗与年龄相关疾病(如代谢综合征、炎症性疾病等)的新型药物。然而,尽管SIRT6在调控多种生物过程中的作用已经被广泛研究,但关于SIRT6新兴的功能仍在持续探索中。未来将深入解析SIRT6的结构功能关系,进一步探讨SIRT6在不同生物学进程中的具体机制,并致力于靶向SIRT6的药物发现,优化激动剂的特异性和高效安全性,为衰老及相关代谢疾病的治疗提供新的策略和途径。

作者贡献声明

刘永慧负责论文初稿的撰写,唐莉、梁泰刚、张健和冯丽参与论文的审阅和修订。所有作者均阅读并同意最终稿件的提交。

AUTHOR's CONTRIBUTIONS

LIU Yonghui drafted the original manuscript. TANG Li, LIANG Taigang, ZHANG Jian, and FENG Li participated in the reviewing and editing. All the authors have read the last version of paper and consented for submission.

利益冲突声明

所有作者声明不存在利益冲突。

COMPETING INTERESTS

All authors disclose no relevant conflict of interests.

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