上海交通大学学报(医学版) ›› 2019, Vol. 39 ›› Issue (1): 47-.doi: 10.3969/j.issn.1674-8115.2019.01.009
陈艳 1,方新宇 1,汪也微 1,倪建良 2,张江涛 2,卢卫红 1,李涛 3,张登峰 4,张晨 1
CHEN Yan1, FANG Xin-yu1, WANG Ye-wei1, NI Jian-liang2, ZHANG Jiang-tao2, LU Wei-hong1, LI Tao3, ZHANG Deng-feng4, ZHANG Chen1
摘要: 目的 ·探索 FOS基因与阿尔茨海默病( Alzheimers disease,AD)的关联性,以及在中国汉族人群中该基因标签单核苷酸多态性( single nucleotide polymorphism,SNP)位点 rs1063169与 AD的关联性。方法 ·使用 Alzdata网站比较 FOS基因在 AD患者不同脑区与健康人群的表达差异,通过 String数据库将 FOS蛋白与 28个 AD相关易感基因编码的蛋白构建蛋白质 -蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,探索该基因在已知数据库中是否与 AD存在关联性。收集中国东部和西南部地区汉族人群中的 AD患者 715例和健康对照 760人,选取 FOS基因标签 SNP位点 rs1063169,采用 SNaPshot SNP分型技术对该位点进行分析。结果 · Alzdata网站的跨平台规范化表达数据显示, AD患者 FOS基因在内嗅皮质( P0.003)和海马区域( P0.001)的表达量与正常人群相比差异有统计学意义。 PPI网络显示, FOS蛋白与载脂蛋白 E(apolipoprotein E,APOE)、聚集素( clusterin,CLU)、淀粉样前体蛋白( β-amyloid precursor protein,APP)、酪氨酸蛋白激酶 -2β(protein-tyrosine kinase 2β,PTK2B)这 4个 AD相关易感基因编码蛋白间存在交互作用。中国东部和西南部地区汉族人群中的 AD患者与健康对照 rs1063169位点基因型及等位基因的分布频率间差异均无统计学意义(均 P>0.05)。结论 ·虽然 FOS基因在 AD患者与健康对照的内嗅皮质和海马中存在差异性表达,且 FOS蛋白可能通过与 AD相关易感基因编码蛋白的交互作用在 AD的发生发展过程中发挥作用,但在该研究收集的中国汉族人群中并未发现 FOS基因 rs1063169多态性与 AD之间的关联性。
中图分类号: